Par testament en date du 2 février 1905, messire Arthur Merghelynck a légué à l'Académie royale de Belgique l'Hôtel-Musée Merghelynck, à Ypres, avec ses dépendances et ses collections, à charge pour l'Académie de lui conserver la destination qu'il avait au jour de son décès, c'est-à-dire d'un musée privé consacré en ordre principal à l'art du XVIIIe siècle.
Par bail emphytéotique, en date du 16 mars 1994, l'Académie royale de Belgique a transféré la gestion du Musée Merghelynck à la Ville d'Ypres.
Selon le vœu du testateur, le Fonds Merghelynck a créé en 1995 un Prix Arthur Merghelynck.
À partir de 1996, ce Prix est octroyé alternativement par la Classe des Beaux-Arts à l'auteur d'un ouvrage d'Histoire de l'art de Belgique, et par la Classe des Lettres à l'auteur d'une publication sur l'Histoire de Belgique (Histoire des familles).
Les propriétés léguées à l'Académie par messire Arthur Merghelynck ont été vendues en 1999.
75% des revenus du capital ainsi obtenu constituent une subvention qui peut être octroyée, annuellement et alternativement, par la Classe des Sciences, la Classe des Lettres et la Classe des Beaux-Arts à partir de l'an 2000. 25% des revenus sont réinvestis afin de maintenir l'intégralité de la valeur du capital initial.
